Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms