Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Akap4Q60662 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms