Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms