Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms