Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms