Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PkdccQ5RJI4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms