Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms