Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf3Q5HZG4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms