Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc8bQ5DU41 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms