Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syce1lQ5D525 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syce1lQ5D525 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms