Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GpkowQ56A08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms