Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms