Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snhg11Q4G0K9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms