Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms