Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms