Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef40Q3UPH7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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