Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms