Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms