Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms