Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Nkx6-3Q3UHX8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Nkx6-3Q3UHX8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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