Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms