Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms