Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms