Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms