Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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Shroom4Q1W617 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shroom4Q1W617 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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Shroom4Q1W617 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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