Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam171bQ14CH0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fam171bQ14CH0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fam171bQ14CH0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fam171bQ14CH0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fam171bQ14CH0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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