Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptcd3Q14C51 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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