Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
StumQ0VBF8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
StumQ0VBF8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms