Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms