Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms