Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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