Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MestQ07646 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MestQ07646 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MestQ07646 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MestQ07646 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms