Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms