Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms