Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprgQ05909 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprgQ05909 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprgQ05909 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprgQ05909 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprgQ05909 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprgQ05909 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms