Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms