Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms