Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms