Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms