Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms