Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms