Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms