Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ascl1Q02067 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms