Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top2aQ01320 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms