Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms