Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms