Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn1P70268 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms