Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrb3P63080 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms