Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UbdP63072 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbdP63072 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms