Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms